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检测血液中是否存在病毒核酸，诊断有无病原体感染。采用PCR技术，使用分子生物学实验室通用的扩增试剂和自行研究开发设计的复合引物，覆盖常见的HIV毒株，具有很高的灵敏度。使用二次扩增的套式PCR扩增方法，提高检测的特异性，降低假阳性的概率。核酸检测将艾滋病病毒的检测窗口期缩短至11天，并且核酸检测这项技术目前可将乙肝、丙肝病毒的检测"窗口期"分别由原来的50天、72天缩短到25天、59天。
核酸提取均采用磁珠法。
1)磁珠提取的原理:
将磁珠上标记特异性吸附核酸的物质特异性吸附核酸，并通过磁分离技术将病毒核酸从裂解液中提取出来。
2)步骤:
裂解-吸附-洗涤-洗涤-洗涤-洗脱
3)优点:
a.磁珠提取特异性高，受标本因素影响小，灵敏度高
b.易于实现自动化
4)缺点:
a.成本较高、并需要一定的仪器(半自动、全自动)。
b.完全手工工作，工作量太大。
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