目前，我国南京玻璃温室大棚制作还存在许多不足，主要是由于传统日光温室所占比例较大，特别是农民建造的太阳能温室，由于成本低，许多菜农看到了商机，太阳能温室的自动化和自发建设过度。

然而，农民建造的太阳能温室结构较差，抵御自然灾害的能力较弱。此外，温室现代化设施、热幕的开合和通风窗的调整基本上依靠人工操作，不仅劳动强度大，而且还需要农民有丰富的经验，否则容易受到冷害、热害和药害。

土地利用率低：一般来说，太阳能温室是成群结队建造的，只有10座建筑和20座建筑，还有50座建筑和60座建筑。由于需要在温室前后保持足够的距离，使室内阳光充足，再加上室外步行和交通道路，集束式太阳能温室覆盖的总面积约占总面积的50辠，而深挖厚壁日光温室的面积甚至更低，约40%。

机械化作业能耗低：日光温室难以实现现代化，特别是难以机械化。每个日光温室的面积都很小，大部分都在一亩以下。农业机械在室内难以合理、有效地运行，产品分类、包装等收获后作业难度较大。