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在有机化学中有很广泛的用途，既可作为基硅基的来源，也可在无水情况下提供氯离子。

醇、胺、羧酸和金属炔化物与迅速反应，分别生成基硅醚、基硅基胺类、硅基酯和硅基炔烃，可用于保护相应的官能团。用保护羟基的反应一般在三级胺中进行。保护后的化合物可通过与氟离子作用而脱去保护基。硅基对酸是不稳定的，并且硅基的引入会使化合物的挥发性增强，使得某些生化样品更易被质谱和气相色谱分析。

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